精囊囊肿患者血精精液外观呈粉红色、暗红色或咖啡色，可持续数年，常无射精痛。以22～24岁多见，血精为首发症状而就诊占40%左右；囊肿合并精囊结石者，在排出血性精液时常有小结石排出。血尿可为全程血尿，也可为初始或终末血尿，尤以排精后初血尿多见。
不育除先天性精囊发育异常外，还有射精管狭窄或梗阻导致少精症、弱精症。长期慢性精囊囊肿致精囊萎缩，功能严重减退，生育力也会降低。部分病人还合并有慢性附睾炎，影响精子输出。国内统计精囊囊肿合并不育占6.8%。
排尿困难是由于囊肿压迫膀胱颈及后尿道所致，其排尿困难程度与囊肿大小及位置有关，国内报道精囊囊肿引起排尿困难占9.1%。病人有尿频、尿急等膀胱刺激症状。
精囊囊肿与前列腺炎的发生可以说是“患难兄弟”。精囊是储存精子的场所，位于膀胱底部与直肠之间，在医生按摩前列腺时，在前列腺两侧上外方，就可以触摸到葡萄大小的囊状物，即为精囊。精囊的排泄管与输精管末端会合成射精管，穿过前列腺进入尿道。精囊囊肿是一种先天性疾病，在超声、CT未问世之前报道较少，近几年随着影像学的发展，尤其腔内超声的问世，对精囊囊肿的报道逐渐增多。精囊囊肿有时会与其他症状一起并发，也可能诱发其他症状。
精囊与前列腺的解剖和生理功能密切相关，两者在感染的来源、临床症状以及诊断方法上都十分相似，而且两者之间常互相影响，据统计经输精管与精囊造影发现87.5%的慢性细菌性前列腺炎患者均有不同程度的病理改变。在慢性病程中，两者常互相存在，相互影响。所以，两者的慢性过程很难鉴别。
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